Исходя из величины обитателей почвы можно разделить на несколько групп:
1. К первой группе относятся микроорганизмы: бактерии, грибы, одноклеточные растения и животные. Они обитают в почвенных порах и полостях или на поверхности почвенных частиц. В среднем на 1 $м^{3}$ почвенного слоя приходится более 100 млрд микроорганизмов. Они способны переносить промерзание почвы, но их активность при этом значительно снижается. Большое количество микроорганизмов содержится в верхнем слое почвы.
2. Ко второй группе относятся животные, которых можно хорошо рассмотреть только с помощью лупы. Это небольшие личинки насекомых, коловратки, тихоходки, клещи, ногохвостки.
3. Третью группу составляют животные, которые хорошо различимы невооружённым глазом (кроты, слепыши), крупные насекомые и дождевые черви.