К мутагенным факторам относят некоторые физические воздействия на организм. Сильнейшим мутагеном является ионизирующее излучение − электромагнитные волны с маленькой длиной волны, но с очень высокой энергией. Мутагенным фактором также является повышенная температура. Сильнейшим мутагенным действием обладают некоторые химические соединения. Относительно недавно выяснилось, что причиной мутаций могут быть вирусы.