Хрящевые рыбы отличаются от костных по нескольким признакам:
1. Скелет у хрящевых рыб хрящевой, а у костных − костный.
2. Чешуя у хрящевых рыб плакоидная, с зубчиками, кожа шероховатая. У костных рыб чешуя гладкая и разного типа.
3. Жабры у хрящевых рыб жаберные щели открытые, без жаберных крышек. У костных рыб жабры прикрыты крышками.
4. Плавательного пузыря у хрящевых рыб нет, они используют жир в печени для плавучести. У костных рыб плавательный пузырь помогает держаться в воде.
5. Размножение у хрящевых рыб − внутреннее оплодотворение, возможны яйцекладение, яйцеживорождение или живорождение. У большинства костных рыб наружное оплодотворение, самка мечет икру.
6. Брызгальца у хрящевых рыб за глазами есть специальные отверстия для поступления воды, у костных рыб их нет.
7. Форма тела у акул тело торпедообразное, у скатов уплощённое. Костные рыбы имеют разную форму тела, но плавники у них не срастаются с туловищем.