Общие черты: кукушкин лён и сфагнум похожи тем, что оба мха имеют гаметофит, который участвует в половом размножении, и спорофит, который развивается после оплодотворения и образует споры для бесполого размножения. У обоих растений для размножения требуется вода, и они могут впитывать её и сохранять. Оба мха способствуют увеличению влажности в местах, где растут.
Отличия: кукушкин лён имеет ризоиды для прикрепления к почве, а сфагнум лишён ризоидов. Сфагнум растёт на верхушке, а его нижняя часть постепенно отмирает, образуя торф. У сфагнума в листьях есть два вида клеток: живые зелёные для фотосинтеза и мёртвые водоносные, которые впитывают воду, как губка. Кукушкин лён таких клеток не имеет. Также кукушкин лён — двудомное растение, а сфагнум — однодомное.