Бактерии размножаются главным образом бинарным делением. Это процесс, при котором клетка делится пополам. Сначала удваивается ДНК, затем клеточная мембрана и оболочка клеток перегибаются и делят клетку на две дочерние. Эти дочерние клетки затем также делятся, и так образуются всё новые и новые клетки. В благоприятных условиях бактерии могут делиться каждые 1—3 часа, а некоторые виды могут производить новое поколение всего за 20 минут. Однако бактерии не могут бесконечно делиться, так как запасы питательных веществ заканчиваются, и они сталкиваются с конкуренцией и отходами жизнедеятельности. У некоторых бактерий также есть процесс, похожий на половое размножение, при котором происходит обмен генетическим материалом, но количество бактерий при этом не изменяется.