В основе систематики водорослей лежат несколько важных признаков. Во−первых, учёные смотрят на цвет водорослей, который зависит от пигментов, например, зелёные, красные или коричневые. Во−вторых, важны местообитания водорослей: одни растут в морях, другие в пресных водоёмах. Эти признаки помогают учёным разделять водоросли на группы и понимать, как они связаны между собой.