Для водорослей характерны два способа размножения: бесполое размножение и половое.
Бесполое размножение водорослей осуществляется через деление клетки надвое. Этот процесс начинается с ядра, которое затем разделяет все части клетки: хроматофор, глазок, вакуоли и цитоплазму. В результате обычно появляются две или четыре дочерние клетки, из которых вырастают новые особи. У многих водорослей дочерние клетки имеют жгутики, что позволяет им свободно перемещаться в водной среде.
Половое размножение происходит путем слияния двух плавающих клеток, принадлежащих разным особям водоросли. В результате образуется зигота, которая затем растёт, делится и становится основой для развития нового организма.