Для северных оленей лишайники служат основным кормом зимой. Одни животные используют лишайники как временное убежище, другие питаются их слоевищами и продуктами разрушения.
Лишайники очень чувствительны к загрязнению окружающей среды. Поэтому отсутствие лишайников может быть показателем экологического неблагополучия. В то же время некоторые из них защищают деревья от вредных микроорганизмов. Это связано с содержанием в них специфических кислот, которые обладают антимикробной активностью. Поэтому такие лишайники используются человеком для получения антибиотиков.
Также из лишайников получают краски, дубильные вещества, лакмус. Их применяют в парфюмерной промышленности для закрепления запаха духов и туалетного мыла.