Какие голосеменные дали начало покрытосеменным, неизвестно до сих пор. Каждый из предлагавшихся вариантов позволяя объяснить происхождение какой−то группы признаков, не позволяет объяснить происхождение прочих признаков. Следовательно надо не просто искать среди голосеменных формы, сходные с покрытосеменными по выборочным, пусть даже очень заметным признакам, которые всегда могут оказаться возникшими независимо.
Одной из наиболее вероятных версий является то, что предками покрытосеменных растений являются користоспермовые семенные папоротники.