В пределах каждой популяции организмов, размножающихся половым путём, происходит постоянный обмен генетическим материалом. Скрещивание особей разных популяций происходит реже, поэтому генетический обмен между разными популяциями ограничен. В результате каждая популяция характеризуется своим специфическим набором генотипов — генофондом. В каждой отдельной популяции накапливаются генотипы, которые наиболее адаптивны к конкретным условиям жизни. Таким образом, каждая популяция эволюционирует независимо от других популяций данного вида.