В основе комбинативной изменчивости лежат три основные причины:
1. Первая причина — это половой процесс, в результате которого возникает огромный набор разнообразных генотипов.
2. Вторая причина комбинативной изменчивости — кроссинговер.
3. Наконец, третья причина комбинативной изменчивости — случайный характер встреч гамет в процессе оплодотворения.