Путешественники, совершающие круиз по Дунаю от его истока до устья, смогут наблюдать значительные изменения природных особенностей вдоль реки. Начиная с истока в Германии, Дунай протекает через горные районы, где можно увидеть красивые пейзажи с высокими горами, зелеными лесами и глубокими долинами. Километров через 30 от истока, Дунай может исчезнуть под землей, так как в этом месте часть его воды просачивается сквозь трещины, щели и воронки в известковых горных породах, слагающих долину реки.
На своём пути Дунай несколько раз меняет направление. Сначала он течёт по горной области Германии на юго−восток, а потом на отметке 2747 км (километраж реки измеряется от крайней точки гирла в направлении истока) меняет направление на северо−восточное. Это направление сохраняется до города Регенсбург (2379 км), где находится самая северная точка течения реки (49°03' с. ш.). Возле Регенсбурга Дунай поворачивает на юго−восток, затем пересекает Венскую котловину, и дальше более чем 600 км течёт по Среднедунайской низменности. Проложив русло через горные цепи Южных Карпат по ущелью Железные ворота, до самого Чёрного моря (более 900 км) протекает по Нижнедунайской низменности.
По мере того как река движется к Вене, она проходит через плоскогорья и холмистые районы, где можно увидеть поля и фермы.
В Вене, путешественники могут наблюдать красивые парки и сады, а также исторические здания и памятники архитектуры. По мере того как река движется дальше к Будапешту, она проходит через пустынные районы и живописные ландшафты. В Венгрии, путешественники могут увидеть обширные пастбища и фермы, а также озера и реки.
В нижнем течении Дунай, разветвляясь, создаёт большую, прорезанную густой сетью рукавов и озёр, болотистую дельту длиною с запада на восток 75 км и шириною с севера на юг 65 км. Вершина дельты находится возле мыса Измаильский Чатал за 80 км от гирла, где основное русло Дуная сначала распадается на Килийское и Тульчинское гирло. Через 17 километров ниже по течению Тульчинское разделяется на Георгиевское гирло и Сулинское гирло, которые впадают в Чёрное море отдельно. Килийское гирло в границах территории Украины создаёт так называемую Килийскую дельту, которая является наиболее быстротечной частью дельты Дуная. Большая часть дельты Дуная покрыта плавнями — это второй по площади массив этого ландшафта в Европе (уступает только плавням в дельте Волги). В дельте Дуная расположен Дунайский биосферный заповедник.