Для красных водорослей характерен фотосинтезирующий пигмент фикоэритрин, который придаёт им красноватый цвет. Этот пигмент маскирует зелёный цвет хлорофилла. Также у красных водорослей присутствуют другие пигменты, которые могут влиять на их окраску в зависимости от глубины, на которой они обитают.