Основные разделы ботаники — это систематика растений, которая описывает виды и распределяет их по группам на основе родства, и морфология, изучающая внешнее строение растений и их органов.
Анатомия исследует внутреннее строение растений с помощью микроскопа. Палеоботаника изучает древние, вымершие растения по окаменелостям. Эмбриология исследует процессы размножения и развития растений. Физиология растений изучает жизненные процессы, такие как фотосинтез, рост и обмен веществ.
Экология растений выясняет, как растения взаимодействуют с окружающей средой и другими организмами.
Геоботаника изучает растительные сообщества, а география растений исследует закономерности распространения растительности на планете.