Личная профилактика протозойных заболеваний связана с действиями каждого человека для защиты себя. Она включает использование кипячёной воды, мытьё рук, тщательное мытьё овощей и фруктов, а также предохранение еды и воды от насекомых и пыли. Общественная профилактика направлена на защиту всех людей. Она включает санитарное просвещение, предотвращение загрязнения почвы и воды, уничтожение мух и тараканов, а также лечение больных. Личная профилактика защищает каждого человека, а общественная — всех сразу.