Эвглена зелёная имеет смешанное питание. Она может питаться как автотрофно, используя хлоропласты с хлорофиллом для фотосинтеза (когда получает свет), так и гетеротрофно, поглощая готовые органические вещества, если она долго находится в темноте. Когда эвглена находит свет, её хлоропласты восстанавливают хлорофилл, и она снова начинает использовать свет для питания.