Радиолярии и фораминиферы играют важную роль в природе и хозяйственной деятельности человека. В природе они помогают образовывать осадочные горные породы. Скелеты этих простейших, особенно радиолярий, образуют плотные слои, которые называются горной мукой или трепелом. Этот материал используется в технике для полировки металлических и стеклянных изделий, а также для изготовления наждачной бумаги. В природе из трепела образуются полудрагоценные камни, такие как яшмы, опалы и халцедоны.