Амёба протей переходит в состояние цисты, когда наступают неблагоприятные условия, такие как холода или высыхание водоёма. В это время её тело становится круглым и покрывается плотной двуслойной оболочкой. В цисте жизненные процессы почти полностью останавливаются, и это помогает амёбе пережить трудные времена, сохраняя вид. Когда условия снова становятся благоприятными, амёба выходит из цисты и возвращается к активной жизни.