Особенность клеточной стенки архей заключается в том, что она может быть как толстой, так и тонкой. Клеточные стенки архей содержат вещество, называемое псевдомуреином, и в некоторых случаях, например у метанобразующих архей, могут состоять из полисахаридов. Также клеточные стенки архей окрашиваются положительно по Граму, как у грамположительных бактерий.