Сапротрофные бактерии встречаются там, где есть органические вещества, которые можно разлагать. Обычно их можно найти в почве, на остатках растений и животных, в компосте, а также в воде, особенно если в ней есть органические отходы. Эти бактерии питаются разлагающимися веществами, превращая их в простые соединения, которые могут использоваться другими организмами.