Роджер Бэкон вступал в конфликт с церковью, так как его учения были основаны не на церковных авторитетах, а на наблюдениях и опыте. Это обстоятельство в связи с его критикой распущенности духовенства навлекло на него преследование духовной власти и 12−летнее тюремное заключение.