1) Текст книги о Крокодиле Гене значительно полнее мультфильма. Да и отличается весьма заметно. В книге есть еще герои, которых нет в мультфильме − крокодил Валера, жираф Анюта и другие.
В мультфильме о друзьях из Простоквашино все герои книги есть.
2) В книге Гена работает в зоопарке не один, а с напарником — крокодилом Валерой. Дом Дружбы не отдают под детсад, а оставляют, как место встреч главных героев. Зато в Детсаду оказывается Чебурашка, который работает там игрушкой. Шапокляк не перевоспитывается, а просто устраняется (её уносит подсунутая связка воздушных шаров).
В книге о друзьях из Простоквашино есть автор, в мультфильме автора нет, о также есть некоторое отличие в сюжете.
3) Зато в книге отсутствует знаменитая фраза «Чебуреки… Чебоксары… Чебурашки нет». Вместо этого Гена ищет в словаре значение слова «леопард».
В мультфильме о друзьях из Простоквашино сюжеты изменены. Конкретнее: в книге первое письмо дяде Фёдору написал Шарик (пёс). В мультфильме письмо мальчику кот и пёс писали вместе. В книге Печкину подарили собаку, которую он назвал Каштанка. В мультике этого нет. Книга и мультфильм очень похожи.
4) Успенский описывал Чебурашку с жёлтыми глазами, а художник изобразил его с чёрными. Мультяшный Чебурашка оказался настолько притягательным, что затмил собой всех прочих персонажей сказки.
В мультфильме о друзьях из Простоквашино герои изображены художниками, как описывал их автор.